色素痣根据痣细胞在皮肤的位置不同可将之分为交界痣、皮内痣及混合痣三种。

交界痣其痣细胞和痣细胞巢主要在皮肤表皮底层与真皮层之间， 其特点是平坦或稍高出皮面，边界欠清、表面光滑、无毛、色泽不一、呈淡黄、瓦青或黑色，身体任何部位均可见，青年人与儿童多见。

皮内痣即痣细胞及痣细胞巢均聚集在真皮层内，常呈扁平状或高出皮呈疣状、色深呈棕褐或漆黑色，且均匀多长有毛。是成年人常见的色素痣，边界清楚、不易发生恶性变。

混合痣中痣细胞与痣细胞巢居表皮深层亦居真皮内者称混合痣。常见痣中央隆突出皮面，长毛，四周呈弥漫分布、色泽不一、界线不清，为交界痣成份，交界痣自幼年期而向皮内痣转变，故年长者少见混合痣。混合痣与交界痣均有发生恶性变的可能。